女性的生殖器疣可能出現在陰道或肛門內、陰道或肛門外，或者子宮頸。而男性的生殖器疣多生長在陰莖、陰囊或肛門。若與已感染性病疣病毒的患者發生口交，生殖器疣則有可能出現在喉嚨或口腔。
部分患者在感染「椰菜花」（性病疣、生殖器疣、尖銳濕疣）初期，並不會出現徵狀；有部分患者只會出現輕微、不明顯的病徵。以下為生殖器疣可能會引起的症狀：

• 生殖器或肛門周圍長出小肉粒（即「疣」），有些表面光滑、扁平，不易察覺；也有些粗糙、突出，狀似椰菜花；
• 小肉粒的顔色有淺白色、淡紅色、粉紅色，甚至黃褐色；
• 疣通常會逐漸增加成簇，形狀像菜花一樣，故有「椰菜花」之稱；
• 生殖器或肛門周圍可能會痕癢或輕微不適，但很少會疼痛；
• 小肉粒可能會因磨損而發炎、流血